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伴随着国家卫生体制改革，江津区疾病预防控制中心于2003年1月在原江津县防疫站基础上成立。中心集“疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导”为一体，担负着“预防疾病、保障健康，为经济建设护航，为全区人民服务”的重任。
在“预防为主”的卫生方针指引下，在区委、区政府、区卫生局和重庆市疾病预防控制中心的领导下，在全区卫生防病人员的共同努力下，为我区的
公共卫生工作做出了积极贡献：全区传染病发病率逐年下降并一直低于重庆市的平均发病水平；成功消灭了脊髓灰质炎；取得了抗击“非典”、防治“二号病”、等重大战役的胜利；完善加强了
免疫规划冷链转运，理顺了生物制品购销渠道，全面开展儿童预防接种门诊规范化建设；积极完成国家项目，如“迈向无烟中国”控烟项目、“英国赠款结核病控制项目”、“中盖艾滋病、结核病项目”，
各项工作跻身重庆市前列。先后获得江津区“十一五”期间科普工作先进集体、“救灾扑疫先进集体”、“结防工作先进集体”、“计划免疫工作先进集体”“疾病控制工作先进集体”、“卫生检测工作先进集体”、“公共卫生工作先进集体”、“食品安全工作先进集体”、“职业卫生工作先进集体”、“英国赠款结核病控制项目先进集体”、“中盖艾滋病项目优秀执行机构”、“健康教育与健康促进先进集体”等多
项荣誉称号。
中心现有在职人员79人，下设行政管理科、技术管理科、流病科、免疫规划科、公共卫生科、职业卫生科、结核病防治科、健康教育科、
微生物检验科、理化检验科、财务科等11个科室。
疾控工作任重道远。中心秉持“为政府担责”、“为领导分忧”、“为群众服务”的原则，团结全区公共卫生人员，以保护群众健康为目标、以振兴事业为己任，为创建一个与我区经济、社会发展水平及人民群众卫生保健需求相适应的一流疾病预防控制中心，确保全区人民的生命安全与身体健康，促进经济建设，维护社会稳定，我中心抓住机遇，于2004年5月开工兴建疾控中心综合楼，于2005年11月正式竣工并投入使用。大楼业务、办公用房达7000平方米，并按照国家实验室标准，建成万级套百级的净化实验室和二级生物安全实验室、理化室验室、微生物室、病毒室验室和艾滋病初筛实验室
。近年来，中心在原有设备基础上，相继购买Waters液相色谱仪（美国）、北分瑞利SP3420气相色谱仪（中国）、PE
800型原子吸收仪（美国）、普析TAS986G原子吸收仪（中国）、梅里埃COMPACT
15型细菌快速鉴定仪（法国）、万通离子色谱仪（瑞士）、西安天龙PCR仪（基因扩增仪）
等仪器设备，取得计量认证、卫生评审等多种资质认定
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